2011年1月11日 星期二

演化理論研究群簡介


來介紹一下演化理論的各個研究群。首先一定不能錯過個性小生Nowak(見圖),他基本上是喊水會結凍,開創許多有趣的研究課題。Harvard挖他過去主持演化研究所(PED),過去的研究成果豐碩,而且林彥誌發現美女一枚

Cornell也有個類似的研究中心(3CPG),陣容龐大,目前Charles ("Chip") Aquadro領軍,結合各個領域的研究者,點著點著就迷路了⋯在德國Max Plank Institute也有生物演化研究所,Traulsen帶領迷你研究群(3個博士後與5個博士生),研究成果也相當出色。德國慕尼黑大學的Frey,就真的是大研究群的大頭。讓我們低級一點好了,光是2010年他的論文就超過20篇,就不必想他的研究群有多大了!

3 則留言:

  1. 有個錯誤是 林彥誌發現的美女一枚 是我告訴他的
    而我是聽我弟他們同學講的
    而我弟同學他們又是從 ptt 看到的
    ->真不知道誰那麼閒找到這個

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  2. 至少七年前的文章....
    據說作者在NYU念生物(台大動物加物理雙主修)
    我一兩年前好像有寄給宏燕看過

    現在再回頭看這文章
    就覺得大家進度好快


    xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
    [轉錄]Summery 一些理論生物的研究

    這幾天在查一些paper,
    順便了解「理論生物學」進展的如何...

    §數學生物(Mathematical Biology)方面

    不愧是模型最完整的
    模型的「格調」也很高,動用了manifold 上的 dynamic system
    看起來有「統一模型」的野心...
    很值得密切注意。

    (之前我說dynamic system多好多好...可能大家不相信
    今天查了paper才知道...已經有人在做了XD)


    §物理方面

    「生物物理」並不是「理論生物」...我想,這是重要的基本觀念
    生物物理只是用「物理界的手段」去研究生物
    對於生物學的概念...並沒有貢獻~~

    物理界,有真的在研究「理論生物」的,
    他們的著手,
    是從entropy、information、self-organization system 來切入的
    多半跟演化、生態的主題有關

    在information的方面
    有一個跟我「層級理論」很像的概念...叫做「群現」(emergence)
    我可能會特別注意這方面...
    畢竟獨立發現的概念...被別人先發現...印象滿深刻的。

    我覺得「群現」跟「複雜」的確是很接近層級理論
    但是缺了生物學的一點sense
    要比數學...我覺得他們的模型很好(我也有我的啦)
    但是還有很多地方...值得精鍊
    所以我的數學要繼續念吧

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  3. §化學、生物方面

    化學、生物方面,做的就是很實際的研究
    主要在 「細胞」「神經科學」「生態」 幾個層級上。


    1.細胞上,做的最有系統的,就是post-genomic
    包括genome-wide的研究,逐個pathway的研究等等
    在模式生物上,來勢洶洶...

    現在做post-genomic的人,化學背景很好
    但是數學、物理的背景知識不佳,
    無法跟前面做「生物數學」或「複雜」的人溝通

    「生物資訊」的idea,多半都是資訊那邊的人出的
    我們生物界的人應該要多努力。

    我之前一直感到「大團化學」的重要性XD
    也就是,一次處理幾十種分子互動的化學...

    我覺得圖論跟群論是很好的模型
    生物資訊的paper,也證實我想的沒錯XD (現在用很多圖論)
    (這個也是獨立發現的XD
    但是已經有人先發現了)


    2.神經科學上,跟信號分析、神經網路的模型息息相關
    因為這些數學跟模型,都在電機、資訊界wild-used

    神經的理論...也許做實驗很困難吧
    這些理論常常用到機率、數理統計,還有信號分析等等
    都是生物學家應該加強的部分

    3.生態方面,主要是跟演化、行為合為一體
    像是賽局理論的數學,就在這裡大放異彩
    大部分的演化模型,都是這學門刺激出來的

    生態學,其實是生物學中很「明顯」要用到數學解決的學科
    因為生態學,是生物中涵蓋層級最多的...
    也是「大數法則」最容易適用的...

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